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靶向代谢组学分析(靶向代谢组学分析维生素)

sfwfd_ve1 商务旅行 2024-02-13 10:15:06 261

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7.多关联双亲染色体片段代换系(CSSL)群体的代谢组分析

本文以三个具有共同轮回遗传背景的染色体片段代换系群体的剑叶为材料,对水稻的代谢多样性进行了分析。

为了剖析荔枝果实成熟的调控网络,文章使用72个种质进行了全基因组关联分析(GWAS),发现一个开花相关基因(LITCHI019307)在荔枝中具差异表达。

这里有一包含 65 个染色体片段置换系( chromosome segment substitution line , CSSL) 的群体 ,产生这一群体的 2 个亲本分别为粳稻 Asominori(背景或轮回亲本) 和籼稻 IR24 (供体或非轮回亲本)。

国内有报道用人类原癌基因Ha-ras-1为探针,对精神病患者基因组进行限止性片段长度多态性的分析,结果提示11号染色体上可能存在着精神分裂症与双相情感性精神病有关的DNA序列。

为此,运用DNA指纹技术可检测不同物种、同种及同种不同个体的亲缘关系,用于物种分类鉴定,也可用于杂交后代亲本决定,杂交后代群体分开,检测近等基因系(或同类系)种的多态性,并对检测基因进行定位。

浅析:NASH和NAFLD的代谢组学研究

Gilead 的NASH / NAFLD动物研究模型中代谢组学的应用 Gilead通过代谢组学为临床前研究在NASH研究中的应用提供了一个很好的例子。

NAFLD可以发展为更危险非酒精性脂肪性肝炎(NASH),这表明炎症和肝细胞损伤以及肝脏中的脂肪都存在。到2030年,美国的NASH病例数也有望攀升至预计的2700万。

NAFLD的致病机制受到多种代谢,遗传和微生物组相关因素的影响。比如遗传差异可影响约20%-70%的疾病风险,PNPLA3基因是与NAFLD易感性相关的最明确遗传变异。这些遗传变异也可能还会影响NAFLD的疾病,如冠状动脉疾病、肥胖。

代谢组学细胞样本收集

1、代谢组学方法已广泛用于动物和植物组织、酵母和细菌靶向代谢组学分析,针对不同的组织和细胞类型开发靶向代谢组学分析了不同的样品收集技术。

2、离心靶向代谢组学分析:将血液样本在4°C下进行离心(例如,3000 g,10分钟),以分离血浆或血清。血浆靶向代谢组学分析:抽血后,立即在4°C下离心(例如,3000 g,10分钟)以分离血浆。血浆位于管子顶部,应小心转移以避免扰动红细胞。

3、代谢组学的研究方法靶向代谢组学分析:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。

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